Im Jahr 1825 bauten die Landwirte John und George Rate die Brennerei und betrieben sie unter dem Namen Milton Distillery, bis sie 1837 lizenziert und umbenannt wurde. Obwohl sie 1853 in ein Sägewerk umgewandelt wurde, kehrte die Brennerei in ihren natürlichen - und stark verbesserten - Zustand zurück und wurde zu dem viktorianischen Meisterwerk aus rotem Backstein, das wir heute kennen. Die traditionellen Bodenmälzereien sind geschlossen, wie viele Malt Whisky Brennereien zu dieser Zeit, und Glenkinchie verwandelt seine alten Mälzereien in ein Brennereimuseum